企业内部数据库开发可以包括以下功能：

1. 数据存储和管理：实现数据的存储和管理，包括创建、更新、删除和查询数据的功能，确保数据的完整性和一致性。

2. 用户权限管理：实现不同用户角色的权限管理，限制对数据库的访问和操作权限，确保数据的安全性和保密性。

3. 数据备份和还原：提供数据备份和还原功能，防止数据丢失和意外操作引起的数据错误。

4. 数据查询和报表生成：提供灵活的数据查询功能，支持多种查询条件和排序方式，同时能够生成定制化的报表和数据分析结果。

5. 数据关联和关系管理：实现数据间的关联和关系管理，如建立主外键关系、处理一对多或多对多关系，确保数据的一致性和完整性。

6. 数据安全和加密：实现对敏感数据的加密和安全传输，保护数据的隐私和机密性。

7. 数据同步和集成：实现与其他系统的数据同步和集成，使不同系统间的数据始终保持一致和同步更新。

8. 性能优化和调优：对数据库进行性能优化和调优，包括索引优化、查询优化、存储结构优化等，提高数据库的查询速度和响应性能。

9. 异常处理和日志记录：实现对数据库操作的异常处理和日志记录功能，及时发现和解决错误和异常情况。

10. 扩展和升级支持：保证数据库系统能够方便地进行扩展和升级，以应对企业的数据增长和未来的需求变化。

难点包括：
1. 数据库设计：良好的数据库设计是关键，需要考虑数据模型、表结构、关系设计等，确保数据的合理性和一致性。

2. 性能优化：数据库性能优化涉及多个方面，如合理使用索引、优化查询语句、调整存储结构等，需要深入理解数据库原理和优化技术。

3. 数据安全：保护数据的安全性和机密性是重要的难点之一，需要使用合适的加密算法、访问控制和审计机制等，防止数据泄露和恶意攻击。

4. 数据一致性和可靠性：保证数据的一致性和可靠性是挑战之一，需要考虑并发访问、错误处理、事务管理等，确保数据的正确性。

5. 扩展性和升级支持：为了应对企业的发展和需求变化，数据库需要具备良好的扩展性和升级支持，需要在设计和开发过程中考虑到这些因素。